244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3935 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3935  selenide, water dikinase  100 
 
 
345 aa  676    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.15655  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0724  selenophosphate synthetase  41.54 
 
 
348 aa  249  4e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1751  selenophosphate synthetase  38.78 
 
 
347 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0711  selenophosphate synthetase  39.34 
 
 
355 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0151  selenophosphate synthetase  38.14 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.270141  normal  0.0151469 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0017  selenophosphate synthetase  39.58 
 
 
335 aa  235  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  33.61 
 
 
351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  35.89 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  34.6 
 
 
323 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  34.2 
 
 
344 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  33.43 
 
 
344 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  35.03 
 
 
345 aa  142  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3578  selenide, water dikinase  38.66 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.319488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  35.29 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  35.91 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  33.14 
 
 
344 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  33.14 
 
 
347 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  31.64 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  32.02 
 
 
347 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  33.52 
 
 
350 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  34.66 
 
 
342 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  32.58 
 
 
344 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  32.66 
 
 
347 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  32.91 
 
 
315 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  34.96 
 
 
357 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  33.79 
 
 
349 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  34.79 
 
 
343 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  31.96 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  34.46 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  33.33 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  32.09 
 
 
347 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  32.09 
 
 
347 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  32.09 
 
 
347 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  34.04 
 
 
344 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  32.09 
 
 
347 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  31.81 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  31.91 
 
 
346 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  34.07 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  34.2 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  32.6 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  32.59 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  33.62 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  33.44 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  32.66 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  34.47 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  33.71 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  31.43 
 
 
347 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  31.3 
 
 
344 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  35.99 
 
 
328 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  32.85 
 
 
345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  31.43 
 
 
347 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  31.43 
 
 
347 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  32.46 
 
 
344 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  31.52 
 
 
347 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  31.52 
 
 
347 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  31.36 
 
 
346 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  31.43 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  31.52 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  31.82 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  35.83 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  33.8 
 
 
369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  31.82 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  38.55 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  35.88 
 
 
358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  34.55 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  31.02 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  35.07 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  30.29 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5214  selenophosphate synthase  39.76 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  30.43 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  38.59 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5302  selenophosphate synthase  39.76 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5594  selenophosphate synthase  39.76 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  32.35 
 
 
355 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  30.72 
 
 
343 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  37.63 
 
 
346 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  34.74 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  34.25 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  34.58 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  33.52 
 
 
351 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  37.2 
 
 
352 aa  129  6e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  36.11 
 
 
385 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  40.29 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  37.91 
 
 
345 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  35.83 
 
 
421 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  34.35 
 
 
347 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  30.64 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  30.64 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  35.1 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  30.64 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  36.22 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  36.11 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  36.11 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  32.23 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  32.47 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  34.43 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  36.11 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  36.11 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  33.24 
 
 
343 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  31.76 
 
 
351 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>