More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5087 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5087  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 259 aa  510  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  33.06 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  33.06 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  33.06 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  30.04 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4930  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.98 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.64 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30.68 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.74 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.5 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.84 
 
 		 296 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  30.9 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  27.47 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  31.9 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  30.9 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  31.51 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  31.51 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  31.51 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 		 324 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  28.09 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 		 324 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 		 324 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  30.67 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3598  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.65 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  29.24 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.71 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12004  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  30.67 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.83 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 		 323 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  27.93 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  27.93 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  30.13 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  30.25 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  30.13 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  30.25 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  30.87 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214609  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7197  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  29.26 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0116141  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1386  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  27.47 
 
 		 323 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.101646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6456  ABC transporter permease  31.47 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1796  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  31.82 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.24 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  31.09 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  30.67 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  33.21 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0334046  normal  0.137928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0116  membrane protein  30.21 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0935043  hitchhiker  0.000854026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.33 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.66 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0101223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189471  normal  0.0804385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>