More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1253 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1253  Phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
425 aa  858    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
428 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
427 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 
428 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  64.51 
 
 
434 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  61.32 
 
 
427 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  65.47 
 
 
437 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  62.97 
 
 
427 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2195  enolase  63.81 
 
 
426 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000497652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  61.65 
 
 
429 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 
428 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02271  phosphopyruvate hydratase  62.47 
 
 
432 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  62.74 
 
 
427 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  63.16 
 
 
433 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 
427 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  61.65 
 
 
428 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  62.76 
 
 
431 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  62.47 
 
 
431 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  61.4 
 
 
433 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  62.06 
 
 
432 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
422 aa  527  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 
429 aa  525  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 
432 aa  525  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 
426 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  61.79 
 
 
428 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 
427 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  60.86 
 
 
424 aa  521  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
427 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  62.12 
 
 
429 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 
427 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  62.21 
 
 
430 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
427 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  63.51 
 
 
429 aa  520  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  60.71 
 
 
429 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 
428 aa  520  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  60.56 
 
 
427 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  60.76 
 
 
428 aa  518  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 
428 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  61.08 
 
 
428 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  63.55 
 
 
424 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  63.27 
 
 
429 aa  518  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  62.35 
 
 
428 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02841  phosphopyruvate hydratase  61.5 
 
 
433 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  62.35 
 
 
430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  62.02 
 
 
424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  61.41 
 
 
429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  61.97 
 
 
430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
427 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
427 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0451  phosphopyruvate hydratase  63.7 
 
 
432 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 
428 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1575  phosphopyruvate hydratase  61.26 
 
 
433 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.837756  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 
428 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 
427 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  62.23 
 
 
430 aa  511  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0339  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
426 aa  513  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
427 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  61.27 
 
 
429 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  61.45 
 
 
431 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
428 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  60.8 
 
 
429 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  61.03 
 
 
426 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  61.99 
 
 
430 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0210  phosphopyruvate hydratase  61.02 
 
 
430 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  61.79 
 
 
427 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  62.02 
 
 
422 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  61.93 
 
 
430 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  61.72 
 
 
425 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  61.79 
 
 
427 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  59.39 
 
 
430 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  60.24 
 
 
427 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1870  phosphopyruvate hydratase  59.95 
 
 
438 aa  504  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000338918  hitchhiker  0.000814995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  59.76 
 
 
425 aa  504  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  61.02 
 
 
430 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  59.67 
 
 
427 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 
425 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 
425 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
431 aa  504  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02261  phosphopyruvate hydratase  61.02 
 
 
430 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.65688  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  61.43 
 
 
424 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  60.42 
 
 
429 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1636  phosphopyruvate hydratase  60.19 
 
 
438 aa  504  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292411  hitchhiker  0.000813655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  60.24 
 
 
426 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  60.66 
 
 
429 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  59.52 
 
 
425 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>