239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0650 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0650  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  706    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.402397 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0848  hypothetical protein  65.68 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  47.11 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  37.73 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  37.73 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  37.42 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  37.73 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  37.12 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  37.42 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  36.67 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  37.73 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  37.73 
 
 		 352 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  37.73 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  37 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  32.59 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  31.45 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  31.31 
 
 		 331 aa  133  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  31.31 
 
 		 331 aa  133  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  31.69 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  31.23 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  33.96 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  31.74 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  31.77 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  32.74 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  33.11 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  33.23 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  34.42 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  30.56 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0264  hypothetical protein  34.54 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  33.02 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  32.6 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  28.8 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  32.59 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  32.59 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  34.26 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  28.57 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  27.61 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  30.51 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  30.09 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  32.38 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  31.45 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  30.99 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  30.2 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  29.57 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  32.89 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  29.97 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  31.58 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  29.45 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  27.81 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  33.11 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  29.89 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  28.96 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  28.96 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  28.65 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  28.77 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  27.15 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  29.79 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  34.02 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  33.92 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  26.2 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  29.43 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  30.88 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  31.48 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  30.83 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  30.6 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  28.66 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  31.48 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  30.92 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  33.79 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  31.48 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  33.79 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  33.79 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  33.79 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  33.79 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  33.79 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  33.79 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  33.79 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  33.79 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  30.74 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  32.48 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  27.5 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  29.96 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  32.4 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  27.72 
 
 		 348 aa  93.2  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  33.56 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  29.35 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  33.56 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  33.56 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  33.56 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  29.54 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  34.24 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  30.73 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  26.55 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  29.63 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  29.63 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  25.87 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  28.67 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  31.98 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  28.72 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  27.36 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>