238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0848 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0848  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  659    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0650  hypothetical protein  66.77 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.402397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  46.76 
 
 
343 aa  265  5.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  40.06 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  40.06 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  39.75 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  40.06 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  39.75 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  39.75 
 
 
340 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  39.08 
 
 
340 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  40.06 
 
 
340 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  39.75 
 
 
352 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  39.75 
 
 
340 aa  195  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  39.75 
 
 
337 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  31.97 
 
 
345 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  33.94 
 
 
331 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  33.94 
 
 
331 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  32.8 
 
 
363 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  33.44 
 
 
340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  31.29 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  32.83 
 
 
357 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  32.39 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  33.55 
 
 
343 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  34.39 
 
 
360 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  34.48 
 
 
338 aa  123  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  34.39 
 
 
360 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.25 
 
 
355 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  29.67 
 
 
339 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  32.15 
 
 
324 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  35.21 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  31.25 
 
 
354 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  34.34 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  31.46 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  35.14 
 
 
349 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 
349 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  35.14 
 
 
349 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  35.14 
 
 
349 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  35.14 
 
 
349 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  35.14 
 
 
349 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  35.14 
 
 
349 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  35.14 
 
 
349 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  35.14 
 
 
349 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  34.46 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  28.81 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  30.13 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  34.12 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  29.38 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  34.12 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  34.12 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  34.12 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  28.9 
 
 
335 aa  110  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  30.77 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  30.79 
 
 
359 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  27.57 
 
 
337 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  30.36 
 
 
365 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  32.13 
 
 
361 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  30.43 
 
 
355 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  30.36 
 
 
365 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0264  hypothetical protein  34.75 
 
 
347 aa  107  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  33.43 
 
 
325 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  29.3 
 
 
335 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  30.64 
 
 
340 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  33.7 
 
 
336 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  29.56 
 
 
352 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  31.79 
 
 
368 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  29.66 
 
 
360 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  29.01 
 
 
335 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  28.24 
 
 
361 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  28.24 
 
 
361 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  32.67 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  30.53 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  28.03 
 
 
380 aa  97.4  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  29.29 
 
 
362 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  29.09 
 
 
329 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  27.33 
 
 
346 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  32.13 
 
 
327 aa  95.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  27.55 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  26.36 
 
 
411 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  28.08 
 
 
342 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  30.1 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  28.96 
 
 
356 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  26.99 
 
 
311 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  30.59 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  27.05 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  28.05 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  28.52 
 
 
343 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  32.22 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  28.05 
 
 
356 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  28.05 
 
 
356 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  28.28 
 
 
358 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  29.45 
 
 
355 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  28.35 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  33.09 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  28.85 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  23.55 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  27.76 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  29.13 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  27.74 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  26.98 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  27.91 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>