58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4032 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  100 
 
 
229 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  37.87 
 
 
250 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  35.32 
 
 
245 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  36.17 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  33.62 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  36.17 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  33.62 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  33.62 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  36.17 
 
 
238 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  33.62 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  35.71 
 
 
229 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  34.47 
 
 
245 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  32.86 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  36.36 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  35.14 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  31.61 
 
 
170 aa  62  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  27.07 
 
 
222 aa  62  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  30.51 
 
 
175 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  32.63 
 
 
152 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  28.03 
 
 
177 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  28.99 
 
 
154 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  26.57 
 
 
152 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  31.37 
 
 
310 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  31.34 
 
 
154 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  25.17 
 
 
345 aa  55.5  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  30.37 
 
 
152 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  28.4 
 
 
311 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  30.23 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  33.05 
 
 
148 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  28.49 
 
 
339 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  28.83 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  29.57 
 
 
145 aa  52  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  33.1 
 
 
179 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  31.78 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  30.33 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  36.05 
 
 
162 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  23.53 
 
 
149 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  36.67 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  25.2 
 
 
145 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.47 
 
 
146 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  28.35 
 
 
153 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  36.9 
 
 
168 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10030  hypothetical protein  30.4 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000144156  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  23.02 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  36.71 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  35.16 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  32.69 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  37.06 
 
 
351 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  31.43 
 
 
144 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  26.67 
 
 
157 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  32.14 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  32.39 
 
 
405 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  26.02 
 
 
158 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1038  hypothetical protein  24.16 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  30.07 
 
 
139 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  35.71 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  29.84 
 
 
385 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  31.52 
 
 
271 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>