50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1366 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  68.44 
 
 
310 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  64.41 
 
 
311 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1993  hypothetical protein  33.51 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  32.28 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  32.28 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  32.28 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  31.75 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  32.28 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  32 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  33.61 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  34.65 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  36.54 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  35.35 
 
 
238 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  33.01 
 
 
181 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  29.03 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  30.48 
 
 
208 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  31.01 
 
 
177 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  28.79 
 
 
144 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  24.07 
 
 
176 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2006  hypothetical protein  33.85 
 
 
228 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  30.94 
 
 
152 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  24.07 
 
 
176 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  29.09 
 
 
177 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  30.48 
 
 
175 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  40.62 
 
 
148 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  23.13 
 
 
152 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  29.01 
 
 
139 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  29.2 
 
 
165 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  31.25 
 
 
170 aa  49.3  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  27.74 
 
 
165 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  25.17 
 
 
162 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  26.83 
 
 
173 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  29.03 
 
 
145 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  26.11 
 
 
152 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  25.68 
 
 
165 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  25.89 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  23.94 
 
 
145 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  39.42 
 
 
162 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  29.29 
 
 
405 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  23.44 
 
 
146 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  20.3 
 
 
154 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  28.12 
 
 
152 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  27.27 
 
 
222 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>