56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2611 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  260  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  91.2 
 
 		 125 aa  214  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  68.99 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  55.04 
 
 		 170 aa  138  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  37.41 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  33.56 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  33.81 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  34.53 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  37.93 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  35.88 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  29.5 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  34.92 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  24.82 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  28.06 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  24.31 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  27.87 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  31.62 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  37.14 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  28 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  34.53 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  28.76 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  31.41 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1038  hypothetical protein  29.27 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  20.86 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  27.95 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  23.81 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  23.81 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  31.08 
 
 		 345 aa  52.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  29.6 
 
 		 310 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  24.16 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  27.08 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  25.74 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.17 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  22.83 
 
 		 311 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  25.71 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  25.98 
 
 		 339 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  30.77 
 
 		 405 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  26.71 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1993  hypothetical protein  23.3 
 
 		 247 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10030  hypothetical protein  30.4 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000144156  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  30.67 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  26.28 
 
 		 277 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  25.5 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  32.18 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  27.78 
 
 		 229 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  27.93 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  27.03 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  27.08 
 
 		 245 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  27.08 
 
 		 245 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  27.08 
 
 		 245 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  27.64 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  27.43 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  24.32 
 
 		 245 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  28.57 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  28.33 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  25.71 
 
 		 179 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>