55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0789 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  100 
 
 
177 aa  339  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  31.11 
 
 
154 aa  84.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  33.11 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  36.3 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  32.47 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  36.51 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  31.69 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  36.29 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  29.17 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  29.45 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  29.45 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  25.17 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  33.57 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  27.48 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  34.56 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  30.92 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  28.17 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  31.94 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  27.46 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  37.59 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  30.16 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  30.56 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  34.92 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10030  hypothetical protein  30.23 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000144156  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  33.09 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  27.86 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  41.77 
 
 
245 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  39.6 
 
 
238 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  26.71 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  30.25 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  35.34 
 
 
245 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  35.34 
 
 
245 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  35.34 
 
 
245 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  29.66 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  29.09 
 
 
339 aa  54.3  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  39.24 
 
 
245 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  42.25 
 
 
277 aa  54.3  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1038  hypothetical protein  27.27 
 
 
296 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  26.32 
 
 
345 aa  52.8  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  28.17 
 
 
139 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  25.87 
 
 
311 aa  51.2  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  30.83 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  37.23 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  29.58 
 
 
405 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  28.3 
 
 
310 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  25.44 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1993  hypothetical protein  25.13 
 
 
247 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  31.15 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  36.84 
 
 
263 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  26.92 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  33.04 
 
 
250 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  24.37 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  28.47 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  25.56 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>