55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1980 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  98.3 
 
 		 176 aa  343  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  43.8 
 
 		 154 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  39.23 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  36.99 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  37.33 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  35.88 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  40.5 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  40.35 
 
 		 148 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  42.86 
 
 		 145 aa  94.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  31.71 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  34.59 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  32.48 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  30.82 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  29.17 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  33.07 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  36.29 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  32.58 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  32 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  29.6 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  34.92 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  32.56 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  34.29 
 
 		 250 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  32.37 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  32.37 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  32.37 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  34.78 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  24.31 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  34.78 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  31.65 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  36.97 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  23.35 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  32.52 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  32.33 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  29.6 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  25.45 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  27.94 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  23.85 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  34.55 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  29.13 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  24.07 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  22.07 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  29.37 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  23.73 
 
 		 310 aa  50.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  21.38 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  26.98 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  26.19 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  38.1 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  27.18 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  21.6 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  23.01 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10030  hypothetical protein  25.95 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000144156  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  28.69 
 
 		 405 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2296  hypothetical protein  36.07 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0824729  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  22.93 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>