21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1038 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1038  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  594  1e-169  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  63.9 
 
 
345 aa  249  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  29.05 
 
 
179 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  35.34 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  29.87 
 
 
165 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  34.92 
 
 
170 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  28.38 
 
 
173 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  30.3 
 
 
139 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  23.03 
 
 
162 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  25.32 
 
 
152 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  27.27 
 
 
177 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  23.33 
 
 
153 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  24.84 
 
 
186 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  27.67 
 
 
144 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  25.5 
 
 
165 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  25.5 
 
 
165 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  26.8 
 
 
152 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  24.67 
 
 
149 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  23.53 
 
 
152 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  28.03 
 
 
125 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>