25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0333 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  690    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1038  hypothetical protein  63.9 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  29.56 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  29.22 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  25.32 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  23.18 
 
 		 186 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  26.62 
 
 		 149 aa  53.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  31.08 
 
 		 139 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  28.97 
 
 		 165 aa  52.8  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  30.08 
 
 		 148 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  26.32 
 
 		 177 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  25.81 
 
 		 154 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  27.03 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  22.67 
 
 		 165 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  24.41 
 
 		 152 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  26.37 
 
 		 229 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  19.02 
 
 		 153 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  22.67 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  24.68 
 
 		 170 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  21.71 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  22.58 
 
 		 154 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  26.43 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  26 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  25.17 
 
 		 152 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  25.34 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.314555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>