54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0763 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  100 
 
 
149 aa  294  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  38.73 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  36.62 
 
 
153 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  38.89 
 
 
177 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  37.93 
 
 
154 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  36.84 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  34.25 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  38.1 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  38.36 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  32.88 
 
 
145 aa  84  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  34.25 
 
 
165 aa  83.6  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  35.07 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  35.46 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  32.64 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  34.29 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  33.59 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  32.88 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  33.07 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  31.97 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  36.55 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  29.45 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  28.77 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  33.1 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  28.77 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  31.62 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  33.09 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  28.99 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  31.58 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  29.29 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  32.61 
 
 
405 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  22.08 
 
 
222 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  26.43 
 
 
170 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  29.37 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10030  hypothetical protein  26.77 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000144156  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  30.56 
 
 
158 aa  53.9  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  28.7 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  25.58 
 
 
231 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  25.58 
 
 
231 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  26.62 
 
 
345 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  31.93 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  28.74 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  33.09 
 
 
304 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2296  hypothetical protein  34.97 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0824729  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1038  hypothetical protein  24.67 
 
 
296 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  32.85 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  29.9 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  27.52 
 
 
238 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1993  hypothetical protein  26.26 
 
 
247 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121122 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  37.36 
 
 
308 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  25.22 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  22.88 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  26.36 
 
 
339 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>