57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1606 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  309  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  58.11 
 
 
175 aa  151  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  55.35 
 
 
170 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2296  hypothetical protein  61.69 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0824729  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  45.18 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  45.77 
 
 
186 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  39.04 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  43.26 
 
 
177 aa  84.3  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  36.62 
 
 
154 aa  84.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  38.41 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  33.85 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  33.8 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  36.55 
 
 
405 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  35.25 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  35.25 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  33.86 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  44.93 
 
 
304 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  29.77 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  36.15 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  31.97 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  39.13 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  40 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  32.8 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  37.82 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  32.85 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  31.47 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  38.1 
 
 
277 aa  63.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  35.83 
 
 
245 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  33.06 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  26.76 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  35.11 
 
 
263 aa  61.6  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  30.4 
 
 
145 aa  61.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  30.97 
 
 
222 aa  61.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  30.34 
 
 
245 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  30.34 
 
 
245 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  30.34 
 
 
245 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  35.45 
 
 
245 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  32.73 
 
 
311 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  27.64 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  32.76 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  29.58 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.17 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  27.56 
 
 
345 aa  51.2  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  24.46 
 
 
145 aa  51.2  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  28.21 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  26.5 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  31.43 
 
 
339 aa  48.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  24.36 
 
 
162 aa  47.8  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  25.15 
 
 
231 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  25.15 
 
 
231 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  26.4 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  32.95 
 
 
310 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  31.69 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  28.8 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  25.62 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  36.28 
 
 
229 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  23.7 
 
 
139 aa  40.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>