40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1573 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  335  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  52.23 
 
 
181 aa  152  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1993  hypothetical protein  48.08 
 
 
247 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  46.25 
 
 
231 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  46.25 
 
 
231 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  45.16 
 
 
208 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1965  hypothetical protein  52.99 
 
 
147 aa  131  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149175  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2006  hypothetical protein  36.84 
 
 
228 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  27.39 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  26.8 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  27.1 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  25.66 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  30 
 
 
311 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  31.41 
 
 
139 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  27.1 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  31.41 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  27.52 
 
 
158 aa  51.2  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  31.52 
 
 
310 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  28 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  26.8 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  24.39 
 
 
222 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  25.32 
 
 
145 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  26.92 
 
 
177 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.47 
 
 
170 aa  47.4  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  26.21 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  29.35 
 
 
339 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  25.81 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  26.62 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  25.97 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  26.47 
 
 
245 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  24.68 
 
 
345 aa  44.3  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  26.19 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  29.17 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1038  hypothetical protein  24 
 
 
296 aa  41.6  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  29.36 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  22.88 
 
 
149 aa  41.2  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  24.05 
 
 
186 aa  40.8  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  25.32 
 
 
152 aa  40.8  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>