52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05640 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1357  hypothetical protein  87.74 
 
 
157 aa  254  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  normal  0.328622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10030  hypothetical protein  80.39 
 
 
155 aa  226  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000144156  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  41.1 
 
 
165 aa  115  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  39.04 
 
 
154 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  46.15 
 
 
152 aa  100  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  33.78 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  36.31 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  32.62 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  34.97 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  33.79 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  33.05 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  27.81 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  33.04 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  30.57 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  31.91 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  34.91 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  31.62 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  29.17 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  30.41 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  27.08 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  25.17 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  25.85 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  25.87 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  24.67 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  31.78 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  32.08 
 
 
245 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  27.59 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  27.34 
 
 
245 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  27.34 
 
 
245 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  27.34 
 
 
245 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  30.72 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  27.86 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  25.19 
 
 
176 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  27.52 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  33.06 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  23.88 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  27.56 
 
 
245 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  28.77 
 
 
263 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  23.61 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  27.22 
 
 
231 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  27.22 
 
 
231 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  29.32 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  29.59 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  26.15 
 
 
222 aa  44.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  28.3 
 
 
277 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  28.81 
 
 
245 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  28.57 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  30 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  27.87 
 
 
229 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1993  hypothetical protein  32.32 
 
 
247 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  29.63 
 
 
250 aa  40.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>