47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1993 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1993  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  51.75 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  51.75 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  48.08 
 
 
170 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  45.55 
 
 
181 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  40.19 
 
 
208 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1965  hypothetical protein  46.92 
 
 
147 aa  121  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149175  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  33.96 
 
 
339 aa  85.5  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2006  hypothetical protein  33.65 
 
 
228 aa  85.5  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  33.75 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  29.8 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  27.96 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  26.06 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  26.06 
 
 
154 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  24.6 
 
 
154 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  27.62 
 
 
152 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  25.57 
 
 
139 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  25.47 
 
 
146 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  24.87 
 
 
177 aa  55.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  30.87 
 
 
152 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  22.6 
 
 
177 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  24.16 
 
 
145 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  26.26 
 
 
149 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1806  hypothetical protein  24.53 
 
 
125 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  25.13 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  24.89 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  23.89 
 
 
144 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1275  H+-ATPase subunit H  26.12 
 
 
145 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000867446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  22.31 
 
 
277 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  24.16 
 
 
152 aa  48.5  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  25 
 
 
162 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0937  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  25.93 
 
 
170 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221093  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  24.86 
 
 
152 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  20 
 
 
173 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  27.34 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  31 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05640  hypothetical protein  23.81 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  20.65 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  21.02 
 
 
165 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  25.52 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  23.39 
 
 
345 aa  43.5  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  21.19 
 
 
176 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  22.56 
 
 
186 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  21.21 
 
 
405 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  21.39 
 
 
170 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1038  hypothetical protein  26.38 
 
 
296 aa  42  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>