63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  100 
 
 
229 aa  447  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  63.87 
 
 
238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  55.78 
 
 
245 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  55.78 
 
 
245 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  55.78 
 
 
245 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  55.78 
 
 
245 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  55.38 
 
 
245 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  57.45 
 
 
250 aa  251  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  54.89 
 
 
245 aa  248  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  57.02 
 
 
277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  50.81 
 
 
263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  35.71 
 
 
229 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  28.23 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  36.24 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  39.05 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  37.62 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  32.37 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  28.7 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  36.54 
 
 
339 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  37.63 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  42.05 
 
 
162 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  36.97 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  32.06 
 
 
304 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  41.11 
 
 
173 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  36.13 
 
 
176 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  31.85 
 
 
177 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  35.9 
 
 
177 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  33.05 
 
 
152 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  35.24 
 
 
405 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  39.29 
 
 
168 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  25.58 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  24.09 
 
 
152 aa  52.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  23.7 
 
 
222 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  35.78 
 
 
351 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  29.87 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2083  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  33.05 
 
 
146 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  50 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  37.23 
 
 
177 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  31.13 
 
 
148 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  37.65 
 
 
385 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  23.81 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  23.81 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  28.57 
 
 
274 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  27.08 
 
 
145 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  30.85 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
175 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  30.11 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  26.37 
 
 
345 aa  46.6  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  22.11 
 
 
154 aa  45.1  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  30.36 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2296  hypothetical protein  45.65 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0824729  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  27.78 
 
 
139 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  31.08 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  25.49 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  29.45 
 
 
2196 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  39.71 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  29.9 
 
 
149 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  35.25 
 
 
167 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  28.93 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_002620  TC0584  V-type ATP synthase subunit E  32.89 
 
 
208 aa  42  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.969994  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  24.87 
 
 
181 aa  41.6  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>