49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1112 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  68.44 
 
 
339 aa  414  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  67.31 
 
 
311 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2006  hypothetical protein  35.23 
 
 
228 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1993  hypothetical protein  33.75 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  30.71 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  30.71 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  30.71 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  29.92 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  29.24 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  30.71 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  27.38 
 
 
208 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  37.63 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  30.83 
 
 
245 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  33.96 
 
 
238 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  34.41 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  30.1 
 
 
181 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  26.24 
 
 
263 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  29.3 
 
 
231 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  29.3 
 
 
231 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  27.27 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  35.8 
 
 
152 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  35 
 
 
175 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.57 
 
 
145 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  29.6 
 
 
139 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1169  hypothetical protein  22.95 
 
 
153 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.23333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  23.73 
 
 
176 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  29.46 
 
 
165 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  22.16 
 
 
176 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1573  hypothetical protein  31.52 
 
 
170 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  27.37 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.3 
 
 
177 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  25.71 
 
 
154 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  24.55 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  30.36 
 
 
170 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  27.08 
 
 
152 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  29.27 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  28 
 
 
145 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  25.53 
 
 
173 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  31.36 
 
 
177 aa  46.2  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  26.6 
 
 
165 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  30.53 
 
 
222 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  27.1 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  29.03 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  25.18 
 
 
152 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0333  hypothetical protein  26 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  33.64 
 
 
162 aa  42.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>