More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1381 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1381  ribosomal L11 methyltransferase  100 
 
 
198 aa  394  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0507896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  61.62 
 
 
214 aa  242  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  58.38 
 
 
198 aa  228  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.02 
 
 
316 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.57 
 
 
299 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.94 
 
 
309 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 
290 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  37.95 
 
 
292 aa  98.6  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.25 
 
 
299 aa  97.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2003  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.33 
 
 
293 aa  95.9  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.221022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3151  ribosomal L11 methyltransferase  43.56 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.917593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  34.52 
 
 
276 aa  95.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.96 
 
 
301 aa  95.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.75 
 
 
292 aa  94.7  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
308 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  35.62 
 
 
285 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.76 
 
 
290 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.86 
 
 
303 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.98 
 
 
312 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.45 
 
 
296 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.97 
 
 
295 aa  92  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  32 
 
 
312 aa  92  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  32 
 
 
312 aa  92  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.55 
 
 
315 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.16 
 
 
291 aa  91.7  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.06 
 
 
290 aa  91.7  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 
277 aa  91.3  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1348  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.72 
 
 
275 aa  91.3  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.75 
 
 
312 aa  90.5  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.7 
 
 
327 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.36 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.5 
 
 
287 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.06 
 
 
290 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.57 
 
 
293 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  36.08 
 
 
310 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.06 
 
 
297 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  36.47 
 
 
286 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.69 
 
 
321 aa  89  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
287 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.05 
 
 
294 aa  88.6  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
287 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.96 
 
 
295 aa  88.2  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  34.67 
 
 
284 aa  88.2  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 
296 aa  88.2  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.52 
 
 
315 aa  87.8  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.2 
 
 
292 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1487  ribosomal L11 methyltransferase  42.11 
 
 
285 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000855878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1674  ribosomal L11 methyltransferase  43.75 
 
 
295 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.14 
 
 
278 aa  87.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
296 aa  87.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.24 
 
 
316 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
286 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.22 
 
 
294 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.42 
 
 
292 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.31 
 
 
306 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.87 
 
 
313 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 
317 aa  86.7  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.99 
 
 
312 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.34 
 
 
313 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.57 
 
 
317 aa  85.5  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.8 
 
 
277 aa  85.5  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.43 
 
 
318 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.32 
 
 
313 aa  85.1  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.54 
 
 
306 aa  84.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.82 
 
 
278 aa  84.7  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.91 
 
 
506 aa  84.3  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.96 
 
 
293 aa  84.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.96 
 
 
293 aa  84.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.53 
 
 
300 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.58 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.18 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.54 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.53 
 
 
300 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  36.02 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  36.02 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.3 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.83 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0228  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.08 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00278387  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.8 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.18 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  31.64 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.42 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.16 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.24 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1762  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.54 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.82 
 
 
312 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.73 
 
 
278 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.76 
 
 
295 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.37 
 
 
300 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.55 
 
 
295 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.63 
 
 
289 aa  81.6  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.89 
 
 
300 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.37 
 
 
296 aa  82  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.89 
 
 
300 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  32.4 
 
 
296 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 
300 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.41 
 
 
300 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.41 
 
 
300 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>