More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0868 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0868  ABC transporter related  100 
 
 		 342 aa  665    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  52.54 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 		 352 aa  298  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1103  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  49.28 
 
 		 385 aa  295  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  51.08 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  48.79 
 
 		 351 aa  291  8e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  47.11 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.63 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  47.24 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  49.85 
 
 		 394 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  49.85 
 
 		 394 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2912  ABC transporter ATP-binding protein  48.67 
 
 		 366 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  49.85 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34270  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.67 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  49.43 
 
 		 388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  47.99 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  50 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.06 
 
 		 335 aa  285  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  50.74 
 
 		 398 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  50.15 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  49.54 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  46.2 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  49.71 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  50.15 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.59 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  48.31 
 
 		 391 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  49.23 
 
 		 376 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.58 
 
 		 344 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  52.48 
 
 		 397 aa  282  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  49.69 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.26 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.8 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  44.22 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  48.14 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0235  ABC transporter related  49.07 
 
 		 369 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  46.86 
 
 		 347 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0220  ABC transporter ATP-binding protein  49.07 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333916  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  45.73 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.52 
 
 		 343 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  45.73 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.52 
 
 		 343 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  48.54 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  46.6 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  46.84 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.12 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  46.02 
 
 		 359 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.39 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.63 
 
 		 349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.54 
 
 		 382 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  46.65 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  46.95 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  46.65 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.63 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  51.47 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.45 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6095  ABC transporter related  50.15 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.733778 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.72 
 
 		 384 aa  272  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.51 
 
 		 359 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6508  ABC transporter related  50.15 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  45.65 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1867  ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7230  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.41 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.983063  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.58 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  49.54 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 		 335 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  49.29 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  49.23 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0448  methionine ABC transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1439  ABC transporter, ATP-binding protein  50.15 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  48.77 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>