74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0832 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0832  putative RNA polymerase sigma factor SigI  100 
 
 		 245 aa  497  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3122  putative RNA polymerase sigma factor SigI  49.79 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135176  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3204  putative RNA polymerase sigma factor SigI  49.79 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0084081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3231  putative RNA polymerase sigma factor SigI  49.38 
 
 		 240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.625131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3483  putative RNA polymerase sigma factor SigI  49.38 
 
 		 240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3445  putative RNA polymerase sigma factor SigI  51.32 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3137  putative RNA polymerase sigma factor SigI  49.38 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3441  putative RNA polymerase sigma factor SigI  51.32 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.246792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1813  putative RNA polymerase sigma factor SigI  49.79 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3433  putative RNA polymerase sigma factor SigI  49.79 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2112  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.55 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1739  putative RNA polymerase sigma factor SigI  40.34 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3361  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.01 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0602386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0315  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.76 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2309  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.61 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1698  putative RNA polymerase sigma factor SigI  43.18 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.734467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0403  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.99 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0521455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0074  putative RNA polymerase sigma factor SigI  42.86 
 
 		 218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0058  putative RNA polymerase sigma factor SigI  40.44 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2521  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.6 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000234194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1584  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.5 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1128  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.8 
 
 		 255 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2975  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.45 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0268  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.05 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2038  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.02 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4761  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.44 
 
 		 237 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1048  putative RNA polymerase sigma factor SigI  30.6 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0944  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.11 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000529876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1272  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.33 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2120  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.45 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0661  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.65 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00767119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1805  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  38 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1664  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  34.44 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2418  RNA polymerase factor sigma-70  32 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000693947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2732  RNA polymerase factor sigma-70  32 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.814856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2812  RNA polymerase factor sigma-70  35.71 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1431  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  36.62 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0383  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  37.14 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0850  RNA polymerase factor sigma-70  30.3 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000558431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2479  RNA polymerase factor sigma-70  32.2 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000414905  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2011  sigma 28 (flagella/sporulation)  21.9 
 
 		 232 aa  45.8  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2805  flagellar biosynthesis sigma factor  23.44 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.838536  normal  0.135389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2041  RNA polymerase factor sigma-70  30.65 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000162862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3319  RNA polymerase factor sigma-70  32.65 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000496723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45630  flagellar biosynthesis sigma factor  27.12 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531213  normal  0.225194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01000  RNA polymerase factor sigma-70  29.26 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000027918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3872  flagellar biosynthesis sigma factor  27.12 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1693  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.355338  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000740123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0090  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.822440000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0093  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0093  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000656402  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2032  RNA polymerase, sigma 28 subunit  29.76 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5212  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000417002  unclonable  7.821880000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0088  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0093  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000440627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0124  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0114  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0104  RNA polymerase factor sigma-70  34.34 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.05753e-61 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2968  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  30.49 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3710  sigma 28 (flagella/sporulation)  29.58 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  26.43 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0689  RNA polymerase sigma factor SigF  26.67 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0094  RNA polymerase factor sigma-70  33.33 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000196498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1343  flagellar biosynthesis sigma factor  31.94 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.600056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0670  RNA polymerase sigma factor SigF  26.67 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2728  RNA polymerase factor sigma-70  30.83 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2290  flagellar biosynthesis sigma factor  22.12 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0088  RNA polymerase factor sigma-70  34 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000937894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  26.89 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16490  RNA polymerase factor sigma-70  29.63 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0269  RNA polymerase factor sigma-70  33.33 
 
 		 214 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000122079  normal  0.0102214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2280  flagellar biosynthesis sigma factor  30.56 
 
 		 239 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0133422  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  26.88 
 
 		 239 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>