39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1128 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1128  putative RNA polymerase sigma factor SigI  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3361  putative RNA polymerase sigma factor SigI  53.04 
 
 		 294 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0602386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2309  putative RNA polymerase sigma factor SigI  45.33 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1048  putative RNA polymerase sigma factor SigI  40.95 
 
 		 227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4761  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.99 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1584  putative RNA polymerase sigma factor SigI  41.4 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0832  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.8 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1698  putative RNA polymerase sigma factor SigI  39.75 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.734467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2112  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.5 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0661  putative RNA polymerase sigma factor SigI  40.34 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00767119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3122  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.35 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0315  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.17 
 
 		 249 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0403  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.19 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0521455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0074  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.21 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0268  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.76 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1739  putative RNA polymerase sigma factor SigI  31.22 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2975  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.21 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3204  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.56 
 
 		 240 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0084081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3231  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.56 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.625131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3483  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.56 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3441  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.05 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.246792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3445  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.56 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3433  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.05 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1813  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.05 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3137  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.56 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2521  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.55 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000234194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2038  putative RNA polymerase sigma factor SigI  31.11 
 
 		 236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0058  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.65 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2120  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.97 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1272  putative RNA polymerase sigma factor SigI  31.22 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0944  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.62 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000529876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1805  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  47.89 
 
 		 114 aa  72  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2968  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  35.38 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1422  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  33.33 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0109521  normal  0.320143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2812  RNA polymerase factor sigma-70  32.65 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0140144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  27.1 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  27.1 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1496  sigma 28 (flagella/sporulation)  28.32 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1664  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  27.63 
 
 		 246 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>