48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6620 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6620  tetracycline repressor domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 283 aa  80.5  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 315 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 311 aa  68.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 269 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 235 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 272 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 248 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 239 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 272 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  28.68 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 249 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  29.32 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 241 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  32.06 
 
 		 266 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  28.79 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  28.35 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 249 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 247 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 221 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 218 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 268 aa  41.6  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 235 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 272 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 259 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 237 aa  41.2  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  27.16 
 
 		 215 aa  41.2  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 250 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>