164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5893 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0721  glycosyl transferase, group 1  81.94 
 
 		 534 aa  862    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.920452  normal  0.491923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5893  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 519 aa  1047    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1814  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.506026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1271  glycosyl transferase group 1  21.57 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0273586  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0810  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 413 aa  67  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.286793  normal  0.59117 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1739  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 818 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.7 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0733  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1213  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.033035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1991  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 370 aa  62  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35087  predicted protein  26.07 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  26.86 
 
 		 820 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  25.93 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.09 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2037  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000383796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3448  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.86 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54621  glycosyl transferase, family 1  28.96 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  29.29 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1680  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1810  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 		 857 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  26.8 
 
 		 820 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3129  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 414 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 		 856 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 		 856 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 		 820 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 		 820 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  26.8 
 
 		 820 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  26.8 
 
 		 820 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0836  glycosyltransferase  26.1 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.260131  hitchhiker  0.000830652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20091  glycosyltransferase  27.15 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3230  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 		 409 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 		 364 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0349  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 398 aa  54.3  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.329915 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  29.55 
 
 		 407 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  28.98 
 
 		 407 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4215  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 374 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 394 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  41.57 
 
 		 890 aa  53.9  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6492  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 402 aa  53.5  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737986  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0632  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 413 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13661  glycosyltransferase  25.88 
 
 		 401 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.244313  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0032  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0810  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0314392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  34.78 
 
 		 794 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0524  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0496  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 		 371 aa  53.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166114  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2880  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.447923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2204  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0647  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2502  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0300016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 377 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 377 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2100  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 828 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3127  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 		 380 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.020191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0381  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1037  putative glycosyltransferase group 1 family protein  28.77 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3728  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 397 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0346462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3401  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1127  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 402 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.353198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3320  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 386 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2781  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 386 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2264  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 		 385 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 385 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1466  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 403 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1553  glycosyltransferase  27.07 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451561  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1681  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 		 383 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3393  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 678 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1603  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 335 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.535279  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 378 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 821 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3451  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 810 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0516  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628757  normal  0.125688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3532  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 821 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  20 
 
 		 363 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 388 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 821 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 821 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>