38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3523 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  949    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  59.28 
 
 
441 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  58.94 
 
 
460 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  53.63 
 
 
555 aa  458  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  52.39 
 
 
457 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  52.51 
 
 
556 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  50.71 
 
 
459 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  48.24 
 
 
432 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  46.86 
 
 
424 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  46.68 
 
 
420 aa  395  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  39.82 
 
 
733 aa  355  7.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  41.55 
 
 
429 aa  322  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  27.87 
 
 
474 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  27.21 
 
 
929 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  29.23 
 
 
450 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  27.43 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  26.9 
 
 
466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  27.17 
 
 
443 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  26.58 
 
 
534 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  27.97 
 
 
525 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  25.17 
 
 
423 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  27.52 
 
 
505 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  26.27 
 
 
560 aa  148  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  25.84 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  26.05 
 
 
561 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  26.3 
 
 
396 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.23 
 
 
1967 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  25.61 
 
 
427 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  25.34 
 
 
444 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  26.52 
 
 
444 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  26.11 
 
 
439 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  25.06 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  23.5 
 
 
412 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  29.01 
 
 
536 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  26.16 
 
 
2929 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  25.83 
 
 
2887 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  24.84 
 
 
2453 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  26.11 
 
 
541 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>