33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0251 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  820    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  50.38 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.68 
 
 		 1967 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  36.55 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  35.93 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  34.87 
 
 		 929 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  36.87 
 
 		 423 aa  239  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  35.35 
 
 		 561 aa  229  9e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  35.35 
 
 		 560 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  33.65 
 
 		 474 aa  225  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  34.94 
 
 		 525 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  34.03 
 
 		 534 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  32.18 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  32.44 
 
 		 503 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  30.99 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  30.69 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  31.49 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  31.64 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  31.01 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  32.33 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  28.71 
 
 		 556 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  28.74 
 
 		 459 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  28.77 
 
 		 437 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  28.13 
 
 		 424 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  27.06 
 
 		 441 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  26.44 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  27.32 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  24.76 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  26.3 
 
 		 457 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  26.15 
 
 		 555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  25.97 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  24.77 
 
 		 733 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  25.81 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>