33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6279 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  924    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  64.08 
 
 		 460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  59.28 
 
 		 457 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  56.32 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  56.32 
 
 		 555 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  56.46 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  54.18 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  51.66 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  52.39 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  50 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  45.81 
 
 		 733 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  44 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  30.48 
 
 		 474 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  30.87 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  29.17 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  28.6 
 
 		 525 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  27.89 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  29.05 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  26.6 
 
 		 929 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  28.45 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  27.63 
 
 		 432 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  27.7 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  26.4 
 
 		 423 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  26.52 
 
 		 560 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  26.52 
 
 		 561 aa  160  6e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  27.06 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  25.33 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  26.9 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  25.91 
 
 		 439 aa  139  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.93 
 
 		 1967 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  23.46 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  23.61 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  26.55 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>