33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2429 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  1037    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  57.08 
 
 
474 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  52.13 
 
 
560 aa  502  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  50.98 
 
 
561 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  55.25 
 
 
534 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  52.22 
 
 
525 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  52.28 
 
 
505 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  47.02 
 
 
443 aa  381  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  45.18 
 
 
432 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  42.96 
 
 
439 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  40.91 
 
 
444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  41.14 
 
 
444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  41.57 
 
 
427 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  40.73 
 
 
437 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  37.15 
 
 
450 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  33.82 
 
 
929 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  35.94 
 
 
423 aa  242  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  37.9 
 
 
466 aa  239  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  30.37 
 
 
459 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  32.2 
 
 
432 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  30.87 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  30.47 
 
 
733 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  32.44 
 
 
396 aa  199  9e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  30.87 
 
 
420 aa  196  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  30.02 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.75 
 
 
1967 aa  190  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  31.17 
 
 
424 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  29.14 
 
 
460 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  31.28 
 
 
555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  28.26 
 
 
556 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  27.43 
 
 
457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  30.54 
 
 
429 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  30.75 
 
 
412 aa  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>