33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0531 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  941    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  48.75 
 
 
929 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  48.09 
 
 
423 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  39.21 
 
 
474 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  37.15 
 
 
503 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  37.17 
 
 
534 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  38.39 
 
 
466 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  37.53 
 
 
525 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  36.55 
 
 
396 aa  253  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  35.62 
 
 
561 aa  250  3e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  35.14 
 
 
443 aa  250  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  35.29 
 
 
444 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  35.62 
 
 
560 aa  249  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  35.13 
 
 
444 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  33.84 
 
 
505 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  35.58 
 
 
432 aa  243  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  34.82 
 
 
427 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  34.4 
 
 
439 aa  226  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.98 
 
 
1967 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  30.92 
 
 
459 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  33.41 
 
 
437 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  31.72 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  29.58 
 
 
733 aa  196  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  32.85 
 
 
412 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  31.28 
 
 
424 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  31.12 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  31.22 
 
 
432 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  29.23 
 
 
457 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  29.41 
 
 
460 aa  177  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  29.05 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  30.19 
 
 
555 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  28.88 
 
 
556 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  28.54 
 
 
429 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>