34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3636 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  100 
 
 
555 aa  1146    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  61.11 
 
 
556 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  61.22 
 
 
457 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  57.28 
 
 
459 aa  505  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  58.44 
 
 
460 aa  483  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  56.32 
 
 
441 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  53.63 
 
 
457 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  51.3 
 
 
432 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  54.79 
 
 
424 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  52.42 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  48.57 
 
 
733 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  49.74 
 
 
429 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  32.96 
 
 
474 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  29.08 
 
 
929 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  31.28 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  28.67 
 
 
525 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  30.53 
 
 
432 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  26.92 
 
 
534 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  30.07 
 
 
443 aa  174  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  29.56 
 
 
444 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  30.19 
 
 
450 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  28.87 
 
 
505 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  29.56 
 
 
444 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  28.19 
 
 
560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  30.82 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  26.89 
 
 
423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  27.74 
 
 
561 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  26.15 
 
 
396 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  27.94 
 
 
439 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  26.14 
 
 
427 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  27.06 
 
 
437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.15 
 
 
1967 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  24.88 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.01 
 
 
12684 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>