33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2992 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  913    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  61.4 
 
 
432 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  60.66 
 
 
443 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  46.65 
 
 
427 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  46.56 
 
 
444 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  45.61 
 
 
444 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  44.18 
 
 
474 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  46.65 
 
 
437 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  42.96 
 
 
503 aa  348  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  43.06 
 
 
534 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  41.45 
 
 
561 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  42.59 
 
 
525 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  41.23 
 
 
560 aa  339  5e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  43.56 
 
 
505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  34.4 
 
 
450 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  35.78 
 
 
423 aa  235  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  34.58 
 
 
929 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  32.33 
 
 
396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  35.31 
 
 
466 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.15 
 
 
1967 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  29.89 
 
 
459 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  27.54 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  30.21 
 
 
420 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  29.18 
 
 
424 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  28.57 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  25.91 
 
 
441 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  27.94 
 
 
555 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  25.84 
 
 
556 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  28.73 
 
 
429 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  27.48 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  27.91 
 
 
733 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  26.11 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  30.72 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>