33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4503 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  913    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  63.15 
 
 
432 aa  557  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  60.66 
 
 
439 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  52.27 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  50.11 
 
 
474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  49.65 
 
 
444 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  49.88 
 
 
444 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  50.71 
 
 
437 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  45.08 
 
 
534 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  45.27 
 
 
525 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  47.02 
 
 
503 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  45.27 
 
 
560 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  45.27 
 
 
561 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  43.46 
 
 
505 aa  352  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  38.28 
 
 
423 aa  262  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  36.92 
 
 
929 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  35.14 
 
 
450 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.84 
 
 
1967 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  30.99 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  33.19 
 
 
424 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  29.17 
 
 
441 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  29.38 
 
 
459 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  34.12 
 
 
466 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  29.84 
 
 
457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  31.7 
 
 
432 aa  183  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  32.13 
 
 
420 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  28.54 
 
 
460 aa  176  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  30.07 
 
 
555 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  27.17 
 
 
457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  27.13 
 
 
556 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  29.65 
 
 
733 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  31.57 
 
 
412 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  29.25 
 
 
429 aa  134  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>