34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4068 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  100 
 
 		 929 aa  1882    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  55.24 
 
 		 423 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  48.75 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  38.19 
 
 		 474 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  34.72 
 
 		 534 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  34.4 
 
 		 525 aa  259  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  36.18 
 
 		 432 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  36.05 
 
 		 444 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  35.58 
 
 		 444 aa  252  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  33.54 
 
 		 560 aa  252  3e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  33.68 
 
 		 561 aa  251  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  36.92 
 
 		 443 aa  251  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  36.62 
 
 		 505 aa  251  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  33.82 
 
 		 503 aa  248  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  34.87 
 
 		 396 aa  241  5e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  34.63 
 
 		 427 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  35.44 
 
 		 466 aa  232  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  35.68 
 
 		 432 aa  224  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  36.05 
 
 		 437 aa  224  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  34.58 
 
 		 439 aa  220  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  35.04 
 
 		 420 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  32.22 
 
 		 424 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  36 
 
 		 412 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.55 
 
 		 1967 aa  202  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  29.67 
 
 		 459 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  29.86 
 
 		 457 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  29.08 
 
 		 555 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  29.61 
 
 		 460 aa  191  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  29.77 
 
 		 733 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  27.21 
 
 		 457 aa  181  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  29.16 
 
 		 556 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  26.6 
 
 		 441 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  29.24 
 
 		 429 aa  156  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  31.29 
 
 		 536 aa  48.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>