33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1016 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1036    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  52.64 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  51.08 
 
 		 560 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  50.79 
 
 		 561 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  51.38 
 
 		 525 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  50.31 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  51.02 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  44.35 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  43.46 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  43.39 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  39.87 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  39.44 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  37.5 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  38.65 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  36.05 
 
 		 929 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  33.81 
 
 		 450 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  34.63 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  30.2 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  30.5 
 
 		 733 aa  202  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.47 
 
 		 1967 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  30.06 
 
 		 459 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  31.64 
 
 		 396 aa  195  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  31.26 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  29.92 
 
 		 432 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  30.02 
 
 		 556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  27.58 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  28.96 
 
 		 424 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  28.45 
 
 		 555 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  26.74 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  29.72 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  26.86 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  30.15 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>