34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2684 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  100 
 
 		 534 aa  1104    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  82.27 
 
 		 525 aa  872    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  76.45 
 
 		 560 aa  840    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  77.04 
 
 		 561 aa  842    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  52.06 
 
 		 503 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  50.41 
 
 		 474 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  52.65 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  46.15 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  45.08 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  42.3 
 
 		 427 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  42.56 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  42.11 
 
 		 444 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  43.06 
 
 		 439 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  36.84 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  35.93 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  34.16 
 
 		 929 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  37.18 
 
 		 466 aa  248  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  33.64 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  34.03 
 
 		 396 aa  225  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  30.04 
 
 		 432 aa  203  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.79 
 
 		 1967 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  28.57 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  29.74 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  29.22 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  29.71 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  27.91 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  26.61 
 
 		 556 aa  183  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  27.89 
 
 		 441 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  26.48 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  27.13 
 
 		 460 aa  171  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  26.58 
 
 		 457 aa  163  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  28.44 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  29.49 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  23.41 
 
 		 2716 aa  47  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>