61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2643 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2643  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  783    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0542149 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2387  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.19 
 
 		 337 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0908163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1227  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.79 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.01115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0459  hypothetical protein  26.78 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00698134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4258  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.58 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1615  RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)  25.94 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.378938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2189  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.36 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134811  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1035  hypothetical protein  24.37 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.921224  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2266  reverse transcriptase family protein  28.24 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.334675  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1695  reverse transcriptase family protein  28.19 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.517212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2255  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.67 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2079  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.59 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225219  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1321  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.59 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2342  reverse transcriptase family protein  26.52 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.482317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2350  Retron-type reverse transcriptase  22.92 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0447  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.26 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  28.94 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2073  RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)  23.4 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00719283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3200  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.88 
 
 		 467 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  24.5 
 
 		 585 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  23.6 
 
 		 482 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  23.6 
 
 		 482 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  23.6 
 
 		 482 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1387  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.017267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2067  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121404  normal  0.0104805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2778  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2652  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1714  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.125991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2185  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1901  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1923  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0976  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.307448  normal  0.190974 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0812  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.158231  hitchhiker  0.0000219513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0624  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0584  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0142  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.29 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  26.86 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  24.05 
 
 		 727 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  26.86 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2838  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.75 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2550  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.86 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0006691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2375  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.86 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  24.1 
 
 		 585 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1922  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.86 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1878  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.86 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  0.561944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1618  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.86 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000636906  hitchhiker  0.000000000000550097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1463  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.86 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1455  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.86 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.170778  normal  0.343243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0975  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.86 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.171918  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0697  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  22.86 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1269  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.49 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.418772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  30.95 
 
 		 585 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  28.05 
 
 		 490 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.82 
 
 		 731 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1255  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.53 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1481  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  21.89 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.251743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  23.53 
 
 		 472 aa  42.7  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0566133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1373  reverse transcriptase/maturase  24.88 
 
 		 529 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4446  group II intron-encoding maturase, putative  24.82 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687408  hitchhiker  0.0000544163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>