More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3266 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3266  L-sorbose 1-phosphate reductase  100 
 
 
425 aa  875    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02762  predicted dehydrogenase  98.82 
 
 
425 aa  865    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0762  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  98.82 
 
 
425 aa  865    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0779  alcohol dehydrogenase  98.82 
 
 
425 aa  865    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.821862  normal  0.148563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3252  L-sorbose 1-phosphate reductase  91.04 
 
 
424 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3319  L-sorbose 1-phosphate reductase  91.51 
 
 
424 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.928636 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3089  L-sorbose 1-phosphate reductase  98.82 
 
 
425 aa  865    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3073  L-sorbose 1-phosphate reductase  98.59 
 
 
425 aa  867    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0367989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4233  L-sorbose 1-phosphate reductase  98.82 
 
 
425 aa  866    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02725  hypothetical protein  98.82 
 
 
425 aa  865    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001414  putative oxidoreductase  65.24 
 
 
423 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.761888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0699  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.42 
 
 
421 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000632921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1996  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.69 
 
 
410 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000031491  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0421  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.12 
 
 
423 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0673136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5492  L-sorbose 1-phosphate reductase  44.71 
 
 
409 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.647203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4476  L-sorbose 1-phosphate reductase  44.95 
 
 
409 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.240013 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3405  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.61 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0198026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.57 
 
 
344 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
345 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.07 
 
 
346 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1529  alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
577 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4221  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.48 
 
 
346 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.41128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 
346 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.92 
 
 
346 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1218  alcohol dehydrogenase  26.7 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852101  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  24.79 
 
 
345 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.67 
 
 
346 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.09 
 
 
367 aa  90.1  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.94 
 
 
345 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3165  alcohol dehydrogenase  26.74 
 
 
352 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5590  alcohol dehydrogenase  26.43 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  28.41 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.61 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.07 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.26 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  26.54 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1308  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.46 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277534  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  23.87 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  27.09 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  28.71 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  26.27 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.59 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4517  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IID component  53.7 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.25 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  26.35 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.93 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.62 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.62 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.26 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  25.71 
 
 
348 aa  67  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  24.17 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.08 
 
 
363 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1030  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.66 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0743662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  23.74 
 
 
351 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.61 
 
 
341 aa  65.1  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  23.1 
 
 
341 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29840  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  26.49 
 
 
362 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
344 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  24.52 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  22.83 
 
 
341 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  24.51 
 
 
373 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0820  hypothetical protein  23.58 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  21.63 
 
 
342 aa  60.8  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  25.82 
 
 
341 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  23.66 
 
 
341 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0246  alcohol dehydrogenase  25.34 
 
 
343 aa  60.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000123303  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4812  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.48 
 
 
368 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693822  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  22.28 
 
 
341 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  22.28 
 
 
341 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.39 
 
 
350 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  25.62 
 
 
349 aa  59.7  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.37 
 
 
357 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.38 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  26.11 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.19 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  22.28 
 
 
341 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  25.27 
 
 
342 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.96 
 
 
374 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1516  alcohol dehydrogenase  22.73 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.99 
 
 
343 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
343 aa  58.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.04 
 
 
341 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000121162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  22.96 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.59 
 
 
350 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.59 
 
 
350 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  24.59 
 
 
350 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1007  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.08 
 
 
348 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
342 aa  57  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.59 
 
 
350 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.94 
 
 
357 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  24.72 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.92 
 
 
381 aa  56.6  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  24.59 
 
 
350 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  24.59 
 
 
350 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  24.32 
 
 
350 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.72 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0394  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  27.95 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  24.72 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>