205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1700 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1700  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
540 aa  1075    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0402908  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0145  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.71 
 
 
622 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0384189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2176  rhodanese-like protein  42.62 
 
 
544 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0373967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.84 
 
 
566 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.66 
 
 
566 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  28.13 
 
 
558 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.76 
 
 
567 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.82 
 
 
820 aa  89.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.83 
 
 
561 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.13 
 
 
562 aa  88.2  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.990849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.76 
 
 
563 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000959863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0250  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.99 
 
 
564 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1054  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.34 
 
 
564 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000017459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.09 
 
 
568 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  27.26 
 
 
565 aa  76.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1579  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  23.77 
 
 
566 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2087  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.53 
 
 
569 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  22.75 
 
 
562 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A35  fused NAD(FAD)-dependent dehydrogenase/rhodanese domain-containing protein  23.02 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.634534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2254  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.23 
 
 
564 aa  68.2  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  22.86 
 
 
565 aa  66.6  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  20.49 
 
 
598 aa  64.7  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.39 
 
 
572 aa  60.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.471156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1052  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.4 
 
 
571 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0869882  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  29.65 
 
 
189 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4025  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.94 
 
 
580 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783453  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0176  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.87 
 
 
569 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1676  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  22.33 
 
 
555 aa  57  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.18 
 
 
562 aa  56.6  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.563654  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  36.84 
 
 
105 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  30.67 
 
 
189 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1948  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.37 
 
 
570 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
107 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41.56 
 
 
110 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3866  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
166 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  26.14 
 
 
547 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
271 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.41 
 
 
539 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000659316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
352 aa  53.5  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  21.71 
 
 
554 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  21.71 
 
 
554 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 
189 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 
121 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
110 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  24.14 
 
 
554 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  33.75 
 
 
99 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  23.77 
 
 
554 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
290 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
480 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.77 
 
 
247 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0437  NADH oxidase  21.49 
 
 
446 aa  51.6  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0919375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 
480 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3345  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.99 
 
 
562 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl037  NADH oxidase  23.74 
 
 
452 aa  51.2  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1833  NADH oxidase  23.42 
 
 
412 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
277 aa  50.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1398  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.59 
 
 
554 aa  50.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00125379  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
112 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 
115 aa  50.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
124 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.16 
 
 
711 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  34.21 
 
 
99 aa  50.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  35.44 
 
 
142 aa  50.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.67 
 
 
379 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 
471 aa  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 
124 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  23.51 
 
 
554 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  36.71 
 
 
109 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.26 
 
 
138 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 
108 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.9 
 
 
132 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  38.71 
 
 
218 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.2 
 
 
817 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
102 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 
190 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  32.93 
 
 
123 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  26.44 
 
 
567 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
226 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0374  rhodanese-like protein  25.75 
 
 
568 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
199 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 
110 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 
111 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.73 
 
 
118 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
226 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  37.66 
 
 
110 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  30.84 
 
 
139 aa  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.01 
 
 
568 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  36.84 
 
 
479 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
192 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1332  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  21.88 
 
 
837 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0149274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
225 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
225 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.67 
 
 
346 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.64 
 
 
468 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.18 
 
 
484 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.18 
 
 
478 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.18 
 
 
478 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.18 
 
 
484 aa  47.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
220 aa  47.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.01 
 
 
566 aa  47.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>