43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3019 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3019  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  29.69 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 106 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 199 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  29.69 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  29.69 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  27.97 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  29.69 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  29.69 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  36.99 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  43.94 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  38.36 
 
 		 192 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  30.86 
 
 		 488 aa  42.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 194 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  30.89 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  28.91 
 
 		 195 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1223  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.18 
 
 		 197 aa  42.7  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.995499 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 203 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 203 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.27 
 
 		 203 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 203 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 203 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 203 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>