31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2330 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  58.16 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  58 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  58 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  37.85 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  34.86 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  36.1 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  35.51 
 
 		 270 aa  98.2  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  33.94 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  32.86 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  34.63 
 
 		 268 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  34.15 
 
 		 260 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  31.96 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  34.31 
 
 		 260 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  32.7 
 
 		 278 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  32.7 
 
 		 281 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  32.86 
 
 		 285 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  33.48 
 
 		 264 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  37.83 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  32.06 
 
 		 252 aa  85.1  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  32.7 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  32.85 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  33.5 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  33.49 
 
 		 251 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  32.34 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  32.3 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  34.96 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  31.43 
 
 		 276 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  31.43 
 
 		 276 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 		 352 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>