30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1144 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  74.13 
 
 		 278 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  72.28 
 
 		 281 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  72.38 
 
 		 284 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  72.82 
 
 		 281 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  51.6 
 
 		 280 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  47.98 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  50.21 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  49.36 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  47.43 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  48.21 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  43.49 
 
 		 268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  47.86 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  43.81 
 
 		 252 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  40.51 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  42.79 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  41.23 
 
 		 238 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  35.83 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  33.18 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  33.83 
 
 		 235 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  31.78 
 
 		 251 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  30.51 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  34.15 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  32.37 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.69 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  32.11 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  29.46 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  29.19 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  27.91 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  29.61 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>