29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0723 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  82.76 
 
 		 218 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  82.27 
 
 		 230 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  58.1 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  36.41 
 
 		 281 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  36.04 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  34.3 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  35.75 
 
 		 284 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  35.1 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  34.62 
 
 		 278 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  34.78 
 
 		 280 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  32.37 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  34.62 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  34.84 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  34.15 
 
 		 285 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  35.51 
 
 		 270 aa  88.6  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  31.56 
 
 		 258 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  30.4 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  31.39 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  33.05 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  31.55 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  33.82 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  32.84 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  35.98 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  31.07 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  33 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  28.91 
 
 		 276 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  28.91 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  28.5 
 
 		 285 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>