29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2140 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  97.71 
 
 		 230 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  82.91 
 
 		 218 aa  317  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  58 
 
 		 211 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  36.68 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  35.89 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  33.04 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  35.19 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  35.27 
 
 		 280 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  31.58 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  34.13 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  31.88 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  35.58 
 
 		 284 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  33.99 
 
 		 264 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  32.04 
 
 		 270 aa  85.1  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  32.37 
 
 		 260 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  33.65 
 
 		 278 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  33.17 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  36.76 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  32.85 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  30.49 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  35.29 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  34.05 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  32.21 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  30.48 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  30.48 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  29.13 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>