30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2692 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  42.08 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  42.36 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  41.48 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  42.41 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  42.74 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  43.81 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  41.41 
 
 		 284 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  41.59 
 
 		 281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  43.24 
 
 		 268 aa  161  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  43.66 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  42.67 
 
 		 258 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  39.38 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  40.38 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  39.44 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  40.27 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  38.07 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  34.22 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  32.88 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  32.54 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  31.58 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  30.58 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  33.48 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  31.91 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  30.66 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  31.55 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  32.14 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  32.86 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.86 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>