30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6253 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  97 
 
 		 251 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  34.06 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  37.56 
 
 		 260 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  33.18 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  33.48 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  29.41 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  33.47 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  33.91 
 
 		 281 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  33.2 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  32.74 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  37.09 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  32.1 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  32.37 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  31.36 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  33.48 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  29.74 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  35.92 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  37.75 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  33.81 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  34.31 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.59 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  32.84 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  29.07 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  32.34 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  31.94 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  31.08 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  30.18 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  31.08 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  32.24 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>