30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4421 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  80.38 
 
 		 260 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  51.71 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  51.06 
 
 		 281 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  48.07 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  49.36 
 
 		 285 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  50.38 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  49.57 
 
 		 284 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  49.8 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  52.65 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  46.12 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  45.31 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  47.23 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  44.76 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  42.23 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  43.93 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  39.34 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  36.13 
 
 		 270 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  36.45 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  36.45 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  34.31 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  35.27 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  35.58 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.81 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  32.52 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  33.17 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  30.43 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  32.79 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  32.79 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  25.37 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>