31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2365 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  100 
 
 
258 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  87.6 
 
 
258 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  57.36 
 
 
264 aa  296  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  48.46 
 
 
280 aa  232  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  48.77 
 
 
281 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  48.61 
 
 
278 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  48.76 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  46.79 
 
 
280 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  47.92 
 
 
281 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  51.69 
 
 
268 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  48.55 
 
 
285 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  45.31 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  47.23 
 
 
260 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  42.66 
 
 
252 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  44.19 
 
 
270 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  42.18 
 
 
242 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  41.38 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  37.14 
 
 
270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  34.95 
 
 
235 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  32.74 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  32.08 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  34.42 
 
 
245 aa  85.5  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  32.71 
 
 
285 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.33 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  31.75 
 
 
218 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  32.84 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  33.94 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  31.46 
 
 
276 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  31.63 
 
 
276 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  32.22 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  32.14 
 
 
335 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>