30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2299 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  39.64 
 
 
270 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  37.23 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  38.43 
 
 
260 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  37.67 
 
 
281 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  39.11 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  38.6 
 
 
264 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  37.45 
 
 
281 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  37.66 
 
 
268 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  37.56 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  37.86 
 
 
280 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  37.86 
 
 
285 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  37.14 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  37.27 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  37.67 
 
 
258 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  37.2 
 
 
252 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  41.63 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  38.07 
 
 
242 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  29.08 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  31.1 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  35.82 
 
 
218 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  35.51 
 
 
211 aa  89  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  33.5 
 
 
218 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  34.01 
 
 
235 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.35 
 
 
230 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  32.26 
 
 
245 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  27.75 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  28.23 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  28.23 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  26.92 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.144053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>