30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1088 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1088  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0766  protein of unknown function DUF1194  51.85 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.249906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2330  hypothetical protein  40 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000473121  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1299  hypothetical protein  38.33 
 
 
280 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2523  hypothetical protein  36.74 
 
 
270 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2365  protein of unknown function DUF1194  35.32 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2696  protein of unknown function DUF1194  34.08 
 
 
258 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2524  hypothetical protein  37.44 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4135  hypothetical protein  36.45 
 
 
280 aa  98.6  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  0.0522135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2140  hypothetical protein  36.68 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0814  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.18 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943295  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4156  protein of unknown function DUF1194  33.66 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1316  hypothetical protein  34.2 
 
 
281 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1144  hypothetical protein  33.5 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.273143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1215  hypothetical protein  33.91 
 
 
281 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0723  hypothetical protein  36.04 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1397  protein of unknown function DUF1194  33.33 
 
 
278 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0994492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2209  hypothetical protein  34.22 
 
 
264 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532125  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4421  hypothetical protein  34.25 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3063  hypothetical protein  34.94 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2375  hypothetical protein  35.17 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2473  hypothetical protein  34.1 
 
 
284 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2299  hypothetical protein  34.01 
 
 
270 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6253  hypothetical protein  32.39 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2692  hypothetical protein  32.27 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336412  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4033  hypothetical protein  31.88 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.265036  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4866  protein of unknown function DUF1194  29.58 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383278  normal  0.163732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3936  hypothetical protein  32.62 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1533  protein of unknown function DUF1194  30.16 
 
 
276 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1332  hypothetical protein  30.16 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.435427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>